Esta es otra de esas genialidades, que cuando las ves hacen que te golpees la frente y te preguntes: ¿Como mierda no se me ocurrió a mi si es obvio?
du -hs * | sort -h
El comando anterior te ordena todos los archivos del directorio en donde estés parado en ese momento por tamaño y en formato «human-readable».
Muy útil para encontrar cual es el archivo ese que ocupa tanto espacio entre millones. Se lo robé a LinuxCommando.